La chiesa, risalente all’inizio del 1600, dopo l’arrivo a Modugno degli Agostiniani (14 ottobre 1593), fu completata a fine 1617 e consacrata il 18 marzo 1618. Chiesa e convento, soppresse il 13 febbraio 1807, furono concessi al comune, con decreto del 25 aprile 1813 di Gioacchino Murat, con l’obbligo di destinare il convento ad uso ospedaliero, pur tenendo la chiesa aperta al pubblico. Il 15 marzo 1950 fu stipulata una convenzione tra Comune e Diocesi per l’uso perpetuo della chiesa che, il 10 dicembre 1950 fu eretta parrocchia. Il primo riconoscimento di personalità giuridica è dell’11 novembre 1962. Il territorio della parrocchia presenta un alto tasso di mobilità della popolazione.